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Blog de Luis Mochán del Instituto de Ciencias Físicas.

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Física Estadística y Regulación Transcripcional

Enrique Hernández Lemus nos dio el Coloquio del miércoles 3 de marzo, sobre cómo se pueden emplear herramientas de la física estadística para entender enfermedades complejas. Existen enfermedades relacionadas con los genes de un organismo y que sin embargo no están determinadas por ningún gen individual, sino que involucran a un número muy grande de genes. Los genes interaccionan entre sí de una manera compleja y cada uno puede tener una influencia en cómo se expresa cualquiera de los otros. La interacción es muy complicada y es mediada por una serie de proteinas. Lo que propuso el Dr. Hernández es ignorar toda la complejidad derivada de los mecanismos de interacción, considerar estos como una caja negra, aplicar conceptos de mecánica estadistica fuera de equilibrio para generar variables macroscópicas como fuerzas y flujos y obtener potenciales efectivos de energía de un cuerpo y de interacciones de dos cuerpos ajustando las las abundancias de los fragmentos de RNA observados y cerrando los sistemas de ecuaciones empleando métodos de máxima entropía.

Las correlaciones entre las expresiones de diversos genes se traducen en interacciones entre dichos genes, sin tener que recurrir a modelos microscópicos detallados. Estos métodos fueron aplicados al cancer de bocio y de decenas de miles de genes se lograron identificar unas cuantas decenas de genes relacionados con la enfermedad y se establecieron sus interacciones. Parte de las redes de regulación genética así obtenidas se compararon y validaron comparándolas con las interacciones que eran conocidas en forma independiente a este estudio.

El Dr. Hernández charló también sobre el Instituto Nacional de Medicina Genómica y sobre la necesidad de que físicos participen en la solución de problemas biológicos y de la salud.

Cargado a las 14:21 en /mochan/noticiasICF / 20100305Coloquio, | Etiquetas: coloquio, icf, seminario | liga permanente

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